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基因檢測走向臨床,還要打通幾道“關”?

日前,一則新聞曝出了湖南長沙一男嬰因在產前篩查時未診斷出染色體異常的案例。事實上,相似案件在2013年的美國早有發生——據《自然》網站登載,一對俄勒岡州夫婦起訴醫院在唐氏綜合征產前基因測試時由于疏忽導致孩子出生后成為“唐寶”,獲得法院支持,判決醫院賠付300萬美元賠償金。


“從美國醫學的發展歷程看,大幅改進醫療服務的新技術出現后,早期會引起醫學訴訟案例的大幅增加。”美國國家基因研究院實驗室主任楚文江此前撰文表示,此類危機之前出現過3次,而基因檢測技術很可能會帶來新一輪的醫療訴訟高峰。孰是孰非之外,如今的基因檢測產業還有哪些需要完善的地方?基因檢測走向臨床還要打通哪幾道“關”?

基因篩選

缺人才:測序技術需匹配高超醫術

據艾瑞咨詢公司發布的全球二代基因測序行業的投研報告顯示,基因測序可應用于生殖健康、遺傳病檢測、新藥研發、腫瘤診斷及治療、心血管疾病等領域。除了產前篩查和胚胎植入前等基因測序上的應用,臨床應用市場廣闊。

“基因測序技術的發展在臨床感染性疾病的診治中也越來越起到關鍵作用,并且能夠‘挖’出此前不被認識的新型病原體。”復旦大學附屬華山醫院感染科主任張文宏講述了“撒網捕魚”的抗感染故事。

一名發熱待查患者在發生發熱、頭痛、視力下降等多重癥狀兩周多之后到華山醫院就診,此前經外院診斷與治療并無好轉。當時華山醫院已經創建起基因組診斷平臺,于是對該患者的腦嵴液進行了基因測序,以明確病原學診斷。

張文宏解釋,傳統的病原尋找方法要培養病原體,培養過程長,而且是對已知病原體的“定向釣魚”。測序技術無需培養,直接篩查樣本中的病原體,“撒網捕魚”地全面檢測出細菌、病毒、真菌和寄生蟲等近7000種病原菌。最終發現,是豬皰疹病毒傳播感染了患者,這是首次鑒定并治愈該病毒的跨物種傳播和感染。

“但并不是說任何一個病例都需要基因測序,是否測序,測序朝著哪個方向走,都需要醫生根據豐富的經驗給出判斷。”張文宏說,目前仍存在假陽性率等問題,部分技術不僅對于普通消費者來說,對于醫院來說也是非常昂貴的,因此醫生基于豐富的臨床實戰經驗而人給出的先期預判、以及獲得結果后的專業判讀都是精準醫學得以實現的關鍵。

然而,新技術在臨床上的發展卻遭遇了“不同語系”的尷尬。基因層面、分子水平對于疾病的診斷與此前在病癥水平的診斷很可能完全不同。

缺標準:數據質量影響報告準確性

中國食品藥品檢定研究院副院長王佑春研究員用“五多”表示下一代基因測序技術走向標準化應用的難處。“與傳統診斷技術相比,下一代基因測序技術檢測靶點多、通量高、數據量多、分析流程多、質量控制參數多。”這意味著用“整齊劃一”要求每一個檢測程序是艱難的。

王佑春簡要解釋了測序技術的內容:“下一代基因測序的診斷由實驗室操作和生物信息學分析組成,實驗操作部分包括核酸提取、靶序列擴增或捕獲,信息學分析包括讀取數據、過濾數據、拼接序列、比對解讀以及結果報告。”

由于測序的復雜性,對其質量評價面臨著許多挑戰。此外,與傳統診斷技術相比,測序技術包括的生物信息學分析部分是此前所未有的,這要求創建新領域的標準,例如創建數字參考品,包括標準序列或由其組成的標準數據庫等。王佑春表示,“當創建標準進行引導,企業才知道應如何生產這樣的試劑,促進產業走向規范化。”

由于標準的缺失,目前我國在基因檢測的數據質量上令人擔憂。楚文江此前與國內生物企業洽談合作后表示,在數據質量控制方面國內做的還遠遠不夠。如果數據錯了,后期分析、結果都是在浪費時間。

呼喚監管:保障科學性項目最終勝出

“嚴格的監管表面看起來似乎阻礙創新,但它可以保證真正具有科學性的項目最終勝出。”楚文江認為,中國的監管和行業標準相對比較寬松,早期發展迅猛,但在一定的時期內需要撥亂反正,要防止醫學創新被市場綁架。

據2015年底全國性的腫瘤二代測序實驗室質量評估報告結果顯示,其中55%的實驗室是不合格的,甚至22%的實驗室居然得到的是0分。而中國食品藥品檢定研究院最近做過的一項樣本封盲檢測顯示,國內4家測序企業對于同樣的樣本給出的診斷結果并不一致。楚文江認為,目前中國的基因檢測還沒有成熟完整的質量監管體系,體現在數據的準確性上沒有保證。而美國則調動聯邦政府層面比如美國食品藥品監督管理局和美國聯邦醫療保險和醫療救助服務中心,州政府層面比如各州公共衛生部門,以及行業協會等進行多重質量標準和監管。

與楚文江的觀點相似,中國食品藥品檢定研究院劉東來等此前撰文梳理了美國對實驗室研發診斷試劑的監管之路,文章指出,醫療機構此前未能得到明確監管,直接導致了基因檢測市場的種種亂象,既無法保障消費者或患者的切身利益,又無法真正地促進技術創新和行業發展。

監管需要回答的問題包括:檢測者擁有什么的資質,采用什么樣的質量標準,是否定期進行熟練測試等。楚文江認為,這些都是患者關注的問題。

越來越多的獨立實驗室和公司都在進行相關技術的研發,這就導致了監管范圍需要擴大。這也是美國此前面臨的問題。該如何應對?對監管者的考驗仍在繼續。


2019年7月25日-27日,億歐大健康將主辦“GIIS 2019第四屆中國大健康產業升級峰會”,峰會以“雁棲健談——從【規模】到【價值】的醫療變革”為主題,圍繞醫療大數據、醫藥創新、非公醫療和科技醫療四大細分領域的市場環境、投資熱點和產業變革等話題展開探討。

活動報名鏈接:https://www.iyiou.com/post/ad/id/785

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電 話:0818-2378903  
地址:達州市達川商貿物流園區楊柳路116號萊克汽車博覽園配件城1號樓3樓1-24號

基因檢測走向臨床,還要打通幾道“關”?

美國國家基因研究院實驗室主任楚文江此前撰文表示,此類危機之前出現過3次,而基因檢測技術很可能會帶來新一輪的醫療訴訟高峰。孰是孰非之外,如今的基因檢測產業還有哪些需要完善的地方?基因檢測走向臨床還要打通哪幾道“關”?

日前,一則新聞曝出了湖南長沙一男嬰因在產前篩查時未診斷出染色體異常的案例。事實上,相似案件在2013年的美國早有發生——據《自然》網站登載,一對俄勒岡州夫婦起訴醫院在唐氏綜合征產前基因測試時由于疏忽導致孩子出生后成為“唐寶”,獲得法院支持,判決醫院賠付300萬美元賠償金。


“從美國醫學的發展歷程看,大幅改進醫療服務的新技術出現后,早期會引起醫學訴訟案例的大幅增加。”美國國家基因研究院實驗室主任楚文江此前撰文表示,此類危機之前出現過3次,而基因檢測技術很可能會帶來新一輪的醫療訴訟高峰。孰是孰非之外,如今的基因檢測產業還有哪些需要完善的地方?基因檢測走向臨床還要打通哪幾道“關”?

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缺人才:測序技術需匹配高超醫術

據艾瑞咨詢公司發布的全球二代基因測序行業的投研報告顯示,基因測序可應用于生殖健康、遺傳病檢測、新藥研發、腫瘤診斷及治療、心血管疾病等領域。除了產前篩查和胚胎植入前等基因測序上的應用,臨床應用市場廣闊。

“基因測序技術的發展在臨床感染性疾病的診治中也越來越起到關鍵作用,并且能夠‘挖’出此前不被認識的新型病原體。”復旦大學附屬華山醫院感染科主任張文宏講述了“撒網捕魚”的抗感染故事。

一名發熱待查患者在發生發熱、頭痛、視力下降等多重癥狀兩周多之后到華山醫院就診,此前經外院診斷與治療并無好轉。當時華山醫院已經創建起基因組診斷平臺,于是對該患者的腦嵴液進行了基因測序,以明確病原學診斷。

張文宏解釋,傳統的病原尋找方法要培養病原體,培養過程長,而且是對已知病原體的“定向釣魚”。測序技術無需培養,直接篩查樣本中的病原體,“撒網捕魚”地全面檢測出細菌、病毒、真菌和寄生蟲等近7000種病原菌。最終發現,是豬皰疹病毒傳播感染了患者,這是首次鑒定并治愈該病毒的跨物種傳播和感染。

“但并不是說任何一個病例都需要基因測序,是否測序,測序朝著哪個方向走,都需要醫生根據豐富的經驗給出判斷。”張文宏說,目前仍存在假陽性率等問題,部分技術不僅對于普通消費者來說,對于醫院來說也是非常昂貴的,因此醫生基于豐富的臨床實戰經驗而人給出的先期預判、以及獲得結果后的專業判讀都是精準醫學得以實現的關鍵。

然而,新技術在臨床上的發展卻遭遇了“不同語系”的尷尬。基因層面、分子水平對于疾病的診斷與此前在病癥水平的診斷很可能完全不同。

缺標準:數據質量影響報告準確性

中國食品藥品檢定研究院副院長王佑春研究員用“五多”表示下一代基因測序技術走向標準化應用的難處。“與傳統診斷技術相比,下一代基因測序技術檢測靶點多、通量高、數據量多、分析流程多、質量控制參數多。”這意味著用“整齊劃一”要求每一個檢測程序是艱難的。

王佑春簡要解釋了測序技術的內容:“下一代基因測序的診斷由實驗室操作和生物信息學分析組成,實驗操作部分包括核酸提取、靶序列擴增或捕獲,信息學分析包括讀取數據、過濾數據、拼接序列、比對解讀以及結果報告。”

由于測序的復雜性,對其質量評價面臨著許多挑戰。此外,與傳統診斷技術相比,測序技術包括的生物信息學分析部分是此前所未有的,這要求創建新領域的標準,例如創建數字參考品,包括標準序列或由其組成的標準數據庫等。王佑春表示,“當創建標準進行引導,企業才知道應如何生產這樣的試劑,促進產業走向規范化。”

由于標準的缺失,目前我國在基因檢測的數據質量上令人擔憂。楚文江此前與國內生物企業洽談合作后表示,在數據質量控制方面國內做的還遠遠不夠。如果數據錯了,后期分析、結果都是在浪費時間。

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“嚴格的監管表面看起來似乎阻礙創新,但它可以保證真正具有科學性的項目最終勝出。”楚文江認為,中國的監管和行業標準相對比較寬松,早期發展迅猛,但在一定的時期內需要撥亂反正,要防止醫學創新被市場綁架。

據2015年底全國性的腫瘤二代測序實驗室質量評估報告結果顯示,其中55%的實驗室是不合格的,甚至22%的實驗室居然得到的是0分。而中國食品藥品檢定研究院最近做過的一項樣本封盲檢測顯示,國內4家測序企業對于同樣的樣本給出的診斷結果并不一致。楚文江認為,目前中國的基因檢測還沒有成熟完整的質量監管體系,體現在數據的準確性上沒有保證。而美國則調動聯邦政府層面比如美國食品藥品監督管理局和美國聯邦醫療保險和醫療救助服務中心,州政府層面比如各州公共衛生部門,以及行業協會等進行多重質量標準和監管。

與楚文江的觀點相似,中國食品藥品檢定研究院劉東來等此前撰文梳理了美國對實驗室研發診斷試劑的監管之路,文章指出,醫療機構此前未能得到明確監管,直接導致了基因檢測市場的種種亂象,既無法保障消費者或患者的切身利益,又無法真正地促進技術創新和行業發展。

監管需要回答的問題包括:檢測者擁有什么的資質,采用什么樣的質量標準,是否定期進行熟練測試等。楚文江認為,這些都是患者關注的問題。

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